Choć obie postacie Bactrobanu zawierają mupirocynę jako substancję czynną, różnią się one formą chemiczną antybiotyku oraz składem podłoża. Maść na skórę zawiera mupirocynę w stężeniu 2% i ma podłoże na bazie glikolu polietylenowego, które jest odpowiednie dla skóry. Maść do nosa zawiera mupirocynę wapniową, również w stężeniu 2%, ale na specjalnym podłożu dostosowanym do delikatnej błony śluzowej nosa. Maść do nosa ma bardziej miękką konsystencję i została specjalnie opracowana do aplikacji wewnątrznosowej w leczeniu lub eliminacji nosicielstwa bakterii Staphylococcus aureus. Te dwie postacie leku nie są wymienne – maści na skórę nie należy stosować w nosie, a maści do nosa nie wolno aplikować na skórę. Użycie niewłaściwej postaci może być nieskuteczne lub powodować podrażnienia.