Clatexo jest lekiem dobrze tolerowanym. Najczęściej zgłaszane skutki uboczne (obserwowane u 1 do 10 na 100 pacjentów) to:
Ból głowy
Senność (mniej nasilona niż po innych lekach, ale możliwa)
Zawroty głowy
W przypadku wystąpienia rzadkich, ale ciężkich reakcji alergicznych (np. obrzęk twarzy, ust, języka, trudności w oddychaniu), należy natychmiast przerwać stosowanie bilastyny i poradzić się lekarza.