Czas trwania leczenia żelem Virgan zależy od wielu czynników – przede wszystkim od stopnia zaawansowania infekcji, odpowiedzi organizmu na leczenie oraz oceny lekarza prowadzącego. Standardowy schemat terapii zakłada stosowanie leku przez maksymalnie 21 dni, ale w praktyce leczenie może trwać krócej – często do ustąpienia objawów klinicznych i jeszcze kilka dni dłużej, by zapobiec nawrotom.
Bardzo ważne jest, aby nie przerywać leczenia na własną rękę tylko dlatego, że objawy ustąpiły. Wczesne zakończenie terapii może doprowadzić do nawrotu infekcji, czasem w jeszcze cięższej postaci. O dokładnym czasie leczenia powinien zawsze decydować lekarz, najlepiej okulista.